uedbet体育团队解析uedbet开户DdrO结构,提醒遏止去除机制

  DdrO是一种XRE宗族转录按捺因子,与金属蛋白酶PprI合作,关于奇特球菌属物种的DNA损害反响至关重要。

  2019年8月14日,浙江大学uedbet体育教授团队在Nucleic Acids Research 在线宣告了题为“Structure and DNA damage-dependent derepression mechanism for the XRE family member DG-DdrO ”的研讨论文,该研讨初次报导了奇球菌属特有uedbet开户DdrO结构,并提醒了其去转录遏止机制。研讨成果表明,DdrO是一种新式XRE宗族转录调理因子,可构成共同的二聚体。 该结构还供给了奇球菌属中DdrO-PprI介导的DNA损害反响机制的深化了解。

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  奇球菌属是一类够耐受激烈电离辐射、化学诱变剂等压力钳制的极点微生物,具有强壮的DNA损害修正才能,是研讨DNA损害修正的方法生物。uedbet体育教授团队一向致力于耐辐射奇球菌强壮的抗辐射机制的研讨,首先判定了pprI基因是调控钳制呼应的开关,而且发现PprI经过酶切DdrO来免除其转录遏止效果,以呼应外界的钳制。

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DdrO蛋白的结构

  本研讨经过结构生物学和分子生物学手法,使用X射线衍射的办法初次解析了中度嗜热菌(D. geothermalis)中的DdrO蛋白的结构并说明晰其效果机制。结构显现DdrO蛋白由8个α螺旋构成,以同源二聚体方法存在。其二聚化的安稳首要依赖于三个互作界面,N结尾和C结尾都参加了蛋白的二聚化,差异于其他XRE宗族蛋白,是一种新式的二聚化方法。本研讨还发现了一个存在于大部分XRE宗族蛋白中的RE pair,即带有相反电性的精氨酸残基与谷氨酸残基以盐桥相互效果,并参加了二聚体的构成与结合DNA的进程。

  此外,DdrO蛋白的C结尾构成了一个疏水中心。经过C端截短蛋白和点骤变蛋白的生化试验剖析得出,PprI经过酶切DdrO最终一个α螺旋破坏了DdrO蛋白C结尾的疏水中心,影响了C结尾与N端的互作,然后使其失掉二聚体的构象,然后使其不能再结合启动子DNA,免除对相应基因的转录按捺。

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DdrO蛋白C结尾的疏水中心

  综上所述,DdrO经过N结尾结合启动子DNA按捺靶标基因的转录,经过C结尾的疏水中心调控其从DNA的解离,然后去除转录遏止。

  该研讨取得国家重点基础研讨发展计划和国家自然科学基金等项目的支撑。博士生陆慧智为本文的榜首作者,浙江大学uedbet体育教授和赵烨教授为本文通讯作者。

  参阅信息:

  https://academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gkz720/5549711